Меня направят на доп.обследование, а оно наверняка покажет, что у меня нет 3 степени плоскостопия

Вот сходил сегодня в военкомат, так скажем, на консультацию к хирургу, на что он мне сказал, что при мед. осмотре по повестке они меня направят в травматологию (в которой оборудование хуже в разы чем там, где я делал), ну вот вернемся к травматологии, которая, скорее всего, даст результат того, что 3 степени-то и нет у меня, хотя по заключению она есть.

Что мне делать?

Вы можете опираться на имеющиеся у Вас данные, в частности на заключение, согласно которому Вы имеете право на кат. "В".
В случае неудовлетворительного решения призывной комиссии, можете его обжаловать, написав соответствующее заявление.